Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TLCD1Q96CP7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLCD1Q96CP7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLCD1Q96CP7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms