Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC45Q96CN5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRC45Q96CN5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC45Q96CN5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC45Q96CN5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1322.8 ms