Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF653Q96CK0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF653Q96CK0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF653Q96CK0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms