Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEIL2Q969S2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEIL2Q969S2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms