Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TOP1MTQ969P6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TOP1MTQ969P6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms