Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC38A4Q969I6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC38A4Q969I6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms