Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFRSF25Q93038 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFRSF25Q93038 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFRSF25Q93038 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFRSF25Q93038 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms