Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UFD1Q92890 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UFD1Q92890 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UFD1Q92890 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms