Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL2Q92772 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL2Q92772 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms