Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRQ92752 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
TNRQ92752 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
TNRQ92752 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNRQ92752 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNRQ92752 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNRQ92752 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TNRQ92752 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNRQ92752 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNRQ92752 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNRQ92752 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNRQ92752 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNRQ92752 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNRQ92752 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNRQ92752 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TNRQ92752 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TNRQ92752 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNRQ92752 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNRQ92752 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNRQ92752 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNRQ92752 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNRQ92752 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNRQ92752 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNRQ92752 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNRQ92752 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNRQ92752 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNRQ92752 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNRQ92752 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNRQ92752 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNRQ92752 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNRQ92752 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRQ92752 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRQ92752 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRQ92752 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRQ92752 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRQ92752 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
TNRQ92752 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNRQ92752 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNRQ92752 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNRQ92752 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNRQ92752 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNRQ92752 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TNRQ92752 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TNRQ92752 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNRQ92752 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNRQ92752 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TNRQ92752 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNRQ92752 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNRQ92752 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TNRQ92752 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNRQ92752 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNRQ92752 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNRQ92752 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNRQ92752 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNRQ92752 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNRQ92752 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TNRQ92752 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TNRQ92752 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNRQ92752 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNRQ92752 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNRQ92752 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TNRQ92752 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TNRQ92752 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TNRQ92752 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TNRQ92752 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TNRQ92752 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
TNRQ92752 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TNRQ92752 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TNRQ92752 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TNRQ92752 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TNRQ92752 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TNRQ92752 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNRQ92752 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNRQ92752 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNRQ92752 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TNRQ92752 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNRQ92752 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNRQ92752 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNRQ92752 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNRQ92752 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms