Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATL1Q8WXF7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATL1Q8WXF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms