Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKA2Q8WVK7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKA2Q8WVK7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKA2Q8WVK7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms