Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE1Q8WV22 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE1Q8WV22 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms