Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDAC7Q8WUI4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC7Q8WUI4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC7Q8WUI4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms