Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG1Q8WTW3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms