Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SH3RF3Q8TEJ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3RF3Q8TEJ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3RF3Q8TEJ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms