Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC44.52■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
RB1CC1Q8TDY2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.49■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC44.45■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.45■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC44.45■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
RB1CC1Q8TDY2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.44■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC44.43■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC44.41■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
RB1CC1Q8TDY2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms