Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDM1Q8TC05 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms