Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3IL1Q8TBN0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3IL1Q8TBN0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms