Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO3Q8TAP4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO3Q8TAP4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms