Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RP9Q8TA86 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RP9Q8TA86 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms