Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACVR1CQ8NER5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1CQ8NER5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms