Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3C3Q8NEB9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PIK3C3Q8NEB9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms