Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HJURPQ8NCD3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HJURPQ8NCD3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms