Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACBD4Q8NC06 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ACBD4Q8NC06 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms