Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AVL9Q8NBF6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AVL9Q8NBF6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AVL9Q8NBF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms