Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV2

C8orf58, Uncharacterized protein C8orf58, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf58Q8NAV2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C8orf58Q8NAV2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C8orf58Q8NAV2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C8orf58Q8NAV2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms