Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUD6BQ8N6M0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD6BQ8N6M0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms