Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NME8Q8N427 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NME8Q8N427 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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