Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

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Length 1,253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA5B2Q8N398 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VWA5B2Q8N398 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA5B2Q8N398 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA5B2Q8N398 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VWA5B2Q8N398 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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VWA5B2Q8N398 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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VWA5B2Q8N398 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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VWA5B2Q8N398 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWA5B2Q8N398 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWA5B2Q8N398 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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