Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A6

C4orf33, UPF0462 protein C4orf33, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf33Q8N1A6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C4orf33Q8N1A6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C4orf33Q8N1A6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C4orf33Q8N1A6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms