Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHACTR4Q8IZ21 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHACTR4Q8IZ21 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHACTR4Q8IZ21 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms