Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNTD2Q8IXW0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD2Q8IXW0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms