Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCN4BQ8IWT1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCN4BQ8IWT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms