Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC103Q8IW40 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC103Q8IW40 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms