Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APLFQ8IW19 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms