Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDKL3Q8IVW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDKL3Q8IVW4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDKL3Q8IVW4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms