Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC50Q8IVM0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC50Q8IVM0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC50Q8IVM0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms