Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC49Q8IUZ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC49Q8IUZ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRC49Q8IUZ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms