Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VSIG1Q86XK7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
VSIG1Q86XK7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VSIG1Q86XK7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms