Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNMB4Q86W47 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNMB4Q86W47 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms