Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NLRX1Q86UT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRX1Q86UT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NLRX1Q86UT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms