Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHFPL3Q86UP9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LHFPL3Q86UP9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms