Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAINQ86UA6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPAINQ86UA6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPAINQ86UA6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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