Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDB1Q86U70 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LDB1Q86U70 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LDB1Q86U70 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms