Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R42Q7Z4L9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R42Q7Z4L9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R42Q7Z4L9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms