Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLASP1Q7Z460 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLASP1Q7Z460 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CLASP1Q7Z460 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CLASP1Q7Z460 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLASP1Q7Z460 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms