Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NLRP9Q7RTR0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NLRP9Q7RTR0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms