Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRADAQ7RTN6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRADAQ7RTN6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRADAQ7RTN6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms