Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SMIM5Q71RC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMIM5Q71RC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms